Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKAP2LQ8IYA6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP2LQ8IYA6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms