Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP30Q70CQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP30Q70CQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms