Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCYL2Q6P3W7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCYL2Q6P3W7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCYL2Q6P3W7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms