Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODF4Q2M2E3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ODF4Q2M2E3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ODF4Q2M2E3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms