Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCK2Q16822 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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