Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNX2Q13950 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUNX2Q13950 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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