Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKP2Q13309 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SKP2Q13309 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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SKP2Q13309 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKP2Q13309 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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