Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIGQ13278 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIGQ13278 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIGQ13278 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIGQ13278 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIGQ13278 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIGQ13278 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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