Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 MCH4YOL119C 1506 nt5.6□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 VHS2YIL135C 1311 nt5.6□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 SCO1YBR037C 888 nt5.6□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 FHL1YPR104C 2811 nt5.6□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 CTS1YLR286C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 UBP9YER098W 2265 nt5.59□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 YER187WYER187W 426 nt5.59□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 snR10snR10 245 nt5.59□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 MGS1YNL218W 1764 nt5.59□□□□□ -1.51
RUD3Q12234 RPT1YKL145W 1404 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 CUE2YKL090W 1332 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 RPS16BYDL083C 432 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 SRG1SRG1 551 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 ECT1YGR007W 972 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 YLR346CYLR346C 306 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 UIP4YPL186C 915 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PMA1YGL008C 2757 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 ARN1YHL040C 1884 nt5.58□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PHO90YJL198W 2646 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 GTO1YGR154C 1071 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 SPO7YAL009W 780 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 ISU2YOR226C 471 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 MPP10YJR002W 1782 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 FUM1YPL262W 1467 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 SHM1YBR263W 1473 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 UGA1YGR019W 1416 nt5.57□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 AAD4YDL243C 990 nt5.56□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 NPT1YOR209C 1290 nt5.56□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 DNF2YDR093W 4839 nt5.56□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PAL1YDR348C 1500 nt5.55□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 COG1YGL223C 1254 nt5.55□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PPG1YNR032W 1107 nt5.55□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 ASK10YGR097W 3441 nt5.55□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 STE7YDL159W 1548 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PUF3YLL013C 2640 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 HPC2YBR215W 1878 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 NGR1YBR212W 2019 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 DAL81YIR023W 2913 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 IPK1YDR315C 846 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 YER084WYER084W 387 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PAN6YIL145C 930 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 YPL062WYPL062W 405 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 MMP1YLL061W 1752 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 TPS3YMR261C 3165 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 ULA1YPL003W 1389 nt5.54□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 MBP1YDL056W 2502 nt5.53□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 MSC7YHR039C 1935 nt5.53□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.53□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 YDR154CYDR154C 351 nt5.53□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 PIN2YOR104W 849 nt5.53□□□□□ -1.52
RUD3Q12234 SED4YCR067C 3198 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SUA5YGL169W 1281 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SFK1YKL051W 1062 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SHP1YBL058W 1272 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YHR182WYHR182W 2358 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YHR045WYHR045W 1683 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 ATG20YDL113C 1923 nt5.52□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 MHF2YDL160C-A 243 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SCS2YER120W 735 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 RPL28YGL103W 450 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 GRE1YPL223C 507 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 NUP1YOR098C 3231 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 PAP1YKR002W 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SEN34YAR008W 828 nt5.5□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SEC13YLR208W 894 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YPL102CYPL102C 303 nt5.49□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 NOC4YPR144C 1659 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 PRP45YAL032C 1140 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 SNO4YMR322C 714 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 ROX3YBL093C 663 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 HSP33YOR391C 714 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 HSP32YPL280W 714 nt5.48□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 FAA3YIL009W 2085 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 CDC4YFL009W 2340 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YLH47YPR125W 1365 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 COX26YDR119W-A 201 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 ERD1YDR414C 1089 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 CSR1YLR380W 1227 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YTH1YPR107C 627 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 PRP43YGL120C 2304 nt5.47□□□□□ -1.53
RUD3Q12234 YDL144CYDL144C 1071 nt5.46□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 YFR035CYFR035C 345 nt5.46□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 AVO2YMR068W 1281 nt5.46□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 RSC6YCR052W 1452 nt5.45□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 UTR4YEL038W 684 nt5.45□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 AUA1YFL010W-A 285 nt5.45□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.45□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 URA7YBL039C 1740 nt5.45□□□□□ -1.54
RUD3Q12234 GPR1YDL035C 2886 nt5.45□□□□□ -1.54
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