Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPS35P82673 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS35P82673 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS35P82673 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms