Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSE1LP55060 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSE1LP55060 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSE1LP55060 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms