Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD4P55036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD4P55036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD4P55036 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 523.2 ms