Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GBX2P52951 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GBX2P52951 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX2P52951 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX2P52951 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX2P52951 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX2P52951 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GBX2P52951 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GBX2P52951 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBX2P52951 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GBX2P52951 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GBX2P52951 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GBX2P52951 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms