Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC9A3P48764 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC9A3P48764 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms