Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMD8P48556 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD8P48556 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD8P48556 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms