Protein–RNA interactions for Protein: P47078

YJL009W, Uncharacterized protein YJL009W, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL009WP47078 YDL124WYDL124W 939 nt2.93□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 HEM3YDL205C 984 nt2.93□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 CBT1YKL208W 816 nt2.93□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 CNM67YNL225C 1746 nt2.93□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 GEP3YOR205C 1671 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 ASF2YDL197C 1578 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 STP4YDL048C 1473 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YNL095CYNL095C 1929 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 MTQ2YDR140W 666 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YDR541CYDR541C 1035 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 REV7YIL139C 738 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 KRE9YJL174W 831 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YKL031WYKL031W 414 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 PGA3YML125C 939 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 PGA2YNL149C 390 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YPR098CYPR098C 486 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 MRPL36YBR122C 534 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 RKM2YDR198C 1440 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 FRE3YOR381W 2136 nt2.92□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 SEG2YKL105C 3399 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 TRM8YDL201W 861 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 CDC43YGL155W 1131 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YGR022CYGR022C 330 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 DOA1YKL213C 2148 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 TFS1YLR178C 660 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 SNN1YNL086W 309 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 SLD7YOR060C 774 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 RDL1YOR285W 420 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 UBC4YBR082C 447 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YPR195CYPR195C 330 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 BRF1YGR246C 1791 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YAP1801YHR161C 1914 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 ACF2YLR144C 2340 nt2.91□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 SHE10YGL228W 1734 nt2.9□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 RRN3YKL125W 1884 nt2.9□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 MBP1YDL056W 2502 nt2.9□□□□□ -1.94
YJL009WP47078 YDL119CYDL119C 924 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ACT1YFL039C 1128 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YFR035CYFR035C 345 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 COG1YGL223C 1254 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 EGD2YHR193C 525 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PRS1YKL181W 1284 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 LST8YNL006W 912 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 MRPL22YNL177C 930 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YNR048WYNR048W 1182 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ERI1YPL096C-A 207 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 OPY2YPR075C 1083 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PAP1YKR002W 1707 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 GCR2YNL199C 1605 nt2.9□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ALG2YGL065C 1512 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ALD3YMR169C 1521 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ALD2YMR170C 1521 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PIF1YML061C 2580 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 SAP155YFR040W 3009 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 COX26YDR119W-A 201 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 GLO2YDR272W 825 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YER133W-AYER133W-A 342 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PRP43YGL120C 2304 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 NVJ1YHR195W 966 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 FMP33YJL161W 543 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 RPT1YKL145W 1404 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 RFA1YAR007C 1866 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 CSL4YNL232W 879 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 ARR3YPR201W 1215 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 BPL1YDL141W 2073 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YFL034WYFL034W 3222 nt2.89□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PSE1YMR308C 3270 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PEX7YDR142C 1128 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 HSX1tR(CCU)J 72 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 VMA16YHR026W 642 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YLL059CYLL059C 507 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YML101C-AYML101C-A 318 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YMR082CYMR082C 357 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YBL044WYBL044W 369 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 GPM3YOL056W 912 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YPL102CYPL102C 303 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 DED81YHR019C 1665 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 SIA1YOR137C 1869 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 CDC19YAL038W 1503 nt2.88□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 SMF3YLR034C 1422 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 HRP1YOL123W 1605 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 STE20YHL007C 2820 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 GCV1YDR019C 1203 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 HST4YDR191W 1113 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 CAD1YDR423C 1230 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 YGR269WYGR269W 327 nt2.87□□□□□ -1.95
YJL009WP47078 PGU1YJR153W 1086 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms