Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMB5P28074 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB5P28074 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms