Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAMP11215 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAMP11215 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms