Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEFLP07196 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEFLP07196 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEFLP07196 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEFLP07196 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NEFLP07196 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NEFLP07196 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEFLP07196 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEFLP07196 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEFLP07196 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEFLP07196 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEFLP07196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEFLP07196 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NEFLP07196 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEFLP07196 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEFLP07196 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NEFLP07196 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEFLP07196 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEFLP07196 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEFLP07196 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEFLP07196 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEFLP07196 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEFLP07196 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEFLP07196 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEFLP07196 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEFLP07196 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEFLP07196 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEFLP07196 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms