Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP1A1P05023 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1A1P05023 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms