Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM4AO75164 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM4AO75164 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM4AO75164 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM4AO75164 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM4AO75164 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM4AO75164 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM4AO75164 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM4AO75164 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM4AO75164 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM4AO75164 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM4AO75164 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM4AO75164 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM4AO75164 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KDM4AO75164 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms