Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3KR12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3KR12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
J3KR12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
J3KR12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
J3KR12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3KR12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3KR12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KR12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KR12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KR12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KR12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
J3KR12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
J3KR12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
J3KR12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
J3KR12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
J3KR12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
J3KR12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
J3KR12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KR12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KR12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KR12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
J3KR12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
J3KR12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
J3KR12 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
J3KR12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms