Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC188H7C350 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC188H7C350 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms