Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PCDHGB2Q9Y5G2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGB2Q9Y5G2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms