Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF6Q9Y252 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF6Q9Y252 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms