Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNA1Q9UIW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA1Q9UIW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms