Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF11Q9UIL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF11Q9UIL8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF11Q9UIL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms