Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SACSQ9NZJ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms