Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UPF3BQ9BZI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UPF3BQ9BZI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms