Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF12Q96QT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms