Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CKAP2LQ8IYA6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKAP2LQ8IYA6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms