Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWY4

SCUBE1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE1Q8IWY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE1Q8IWY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE1Q8IWY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE1Q8IWY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms