Protein–RNA interactions for Protein: Q86SI9

C5orf38, Protein CEI, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38Q86SI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C5orf38Q86SI9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf38Q86SI9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms