Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP30Q70CQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP30Q70CQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms