Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E1Q6IPT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E1Q6IPT2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms