Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms