Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6HQ13956 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6HQ13956 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6HQ13956 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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