Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNA1CQ13936 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1CQ13936 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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