Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F3Q08477 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP4F3Q08477 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP4F3Q08477 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms