Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNFP41002 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNFP41002 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNFP41002 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNFP41002 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNFP41002 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNFP41002 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNFP41002 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNFP41002 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNFP41002 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNFP41002 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNFP41002 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNFP41002 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNFP41002 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNFP41002 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNFP41002 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNFP41002 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNFP41002 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNFP41002 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNFP41002 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNFP41002 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNFP41002 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNFP41002 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNFP41002 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNFP41002 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNFP41002 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNFP41002 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNFP41002 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.3 ms