Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC12P31275 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms