Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA1P25786 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMA1P25786 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.6 ms