Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP1P23763 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms