Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BMP3P12645 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BMP3P12645 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BMP3P12645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BMP3P12645 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BMP3P12645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BMP3P12645 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BMP3P12645 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BMP3P12645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BMP3P12645 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BMP3P12645 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BMP3P12645 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BMP3P12645 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BMP3P12645 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BMP3P12645 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BMP3P12645 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BMP3P12645 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BMP3P12645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BMP3P12645 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BMP3P12645 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BMP3P12645 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BMP3P12645 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BMP3P12645 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BMP3P12645 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BMP3P12645 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BMP3P12645 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BMP3P12645 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BMP3P12645 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BMP3P12645 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BMP3P12645 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BMP3P12645 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BMP3P12645 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BMP3P12645 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BMP3P12645 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BMP3P12645 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BMP3P12645 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BMP3P12645 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BMP3P12645 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BMP3P12645 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms