Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMBSP08397 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMBSP08397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMBSP08397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMBSP08397 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMBSP08397 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMBSP08397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMBSP08397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMBSP08397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMBSP08397 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMBSP08397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMBSP08397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMBSP08397 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBSP08397 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBSP08397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMBSP08397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBSP08397 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBSP08397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBSP08397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBSP08397 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMBSP08397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBSP08397 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBSP08397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMBSP08397 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms