Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX3O95343 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX3O95343 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX3O95343 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX3O95343 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX3O95343 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX3O95343 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX3O95343 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX3O95343 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX3O95343 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX3O95343 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX3O95343 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX3O95343 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX3O95343 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms