Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD4O95243 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD4O95243 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD4O95243 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD4O95243 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MBD4O95243 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MBD4O95243 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD4O95243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD4O95243 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MBD4O95243 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MBD4O95243 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD4O95243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MBD4O95243 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD4O95243 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD4O95243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MBD4O95243 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MBD4O95243 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MBD4O95243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MBD4O95243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MBD4O95243 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MBD4O95243 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MBD4O95243 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD4O95243 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD4O95243 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD4O95243 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD4O95243 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MBD4O95243 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MBD4O95243 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MBD4O95243 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD4O95243 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD4O95243 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MBD4O95243 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms