Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN7O94888 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN7O94888 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN7O94888 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms