Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP3O75386 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP3O75386 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP3O75386 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP3O75386 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP3O75386 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP3O75386 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP3O75386 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP3O75386 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP3O75386 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP3O75386 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP3O75386 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP3O75386 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP3O75386 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP3O75386 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP3O75386 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP3O75386 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP3O75386 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP3O75386 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP3O75386 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms