Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPLO60437 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPLO60437 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPLO60437 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPLO60437 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PPLO60437 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPLO60437 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPLO60437 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PPLO60437 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PPLO60437 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPLO60437 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPLO60437 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPLO60437 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPLO60437 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PPLO60437 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPLO60437 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PPLO60437 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPLO60437 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPLO60437 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PPLO60437 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPLO60437 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPLO60437 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PPLO60437 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPLO60437 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPLO60437 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPLO60437 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPLO60437 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PPLO60437 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPLO60437 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPLO60437 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPLO60437 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPLO60437 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPLO60437 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPLO60437 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPLO60437 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPLO60437 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPLO60437 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPLO60437 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPLO60437 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPLO60437 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPLO60437 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPLO60437 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPLO60437 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPLO60437 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPLO60437 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPLO60437 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PPLO60437 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPLO60437 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPLO60437 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPLO60437 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPLO60437 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPLO60437 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPLO60437 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PPLO60437 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPLO60437 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPLO60437 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPLO60437 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPLO60437 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPLO60437 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPLO60437 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPLO60437 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPLO60437 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPLO60437 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPLO60437 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPLO60437 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPLO60437 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPLO60437 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPLO60437 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPLO60437 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PPLO60437 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPLO60437 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPLO60437 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPLO60437 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PPLO60437 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PPLO60437 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPLO60437 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPLO60437 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms